生物信息高性能计算后端开发简历范文全文
熊帅帅
展现专业实力,创造职场价值。生物信息高性能计算后端开发工程师
自我评价
5年生物信息与高性能计算后端开发经验,熟悉基因组测序数据分析全流程,主导过PB级数据平台与流程调度系统建设。精通Python、C++、Go及Slurm、Kubernetes集群调度,具备从需求到上线的完整交付能力。曾将大规模变异检测流程耗时缩短60%,支撑日均300+样本稳定运行。
专业技能
Python / C++
Go / Shell
Slurm / Kubernetes
Nextflow / WDL
GATK / BWA / samtools
MySQL / Redis / 对象存储
工作经历
北京基云生物科技有限公司
基因测序生物信息
北京
生物信息后端开发工程师
高性能计算后端开发
2022年9月 - 至今
- 主导基因组分析流程调度平台重构,引入容器化与任务队列,样本处理吞吐提升约2倍。
- 开发PB级结果数据存储与检索服务,接口平均响应从800ms降至200ms以内。
- 搭建流程监控与告警体系,线上任务失败率由8%降至2%以下,保障日均300+样本交付。
上海华科基因技术有限公司
精准医疗基因检测
上海
生物信息工程师
流程开发Linux
2020年7月 - 2022年8月
- 负责WGS/WES变异检测流程开发与优化,单样本分析耗时缩短约60%。
- 使用C++重写比对后处理热点模块,内存占用下降35%,支撑批量样本并行运行。
- 参与搭建Slurm计算集群作业管理脚本,将人工运维工作量减少约50%。
项目经验
大规模基因组分析流程调度平台 - 后端负责人
2024年3月 - 2024年5月
- 基于Kubernetes与消息队列设计任务调度服务,支持千级并发作业与失败自动重试。
- 实现流程版本管理与资源配额控制,集群资源利用率提升约30%。
- 上线后支撑日均300+样本分析,交付周期由5天缩短至2天。
变异检测流程性能优化 - 核心开发
2022年12月 - 2023年2月
- 对GATK流程进行分片并行与I/O优化,整体运行时间缩短约60%。
- 引入缓存与中间结果复用机制,重复分析场景计算成本降低约40%。
教育背景
中国农业大学
985双一流
北京
生物信息学 硕士
2019年8月 - 2021年5月
研究方向:基因组数据分析与高性能计算;主修算法设计、统计遗传学、并行计算。
华中农业大学
211双一流
武汉
生物科学 本科
2016年8月 - 2020年5月
主修分子生物学、遗传学、程序设计基础;通过CET-6。
证书与认证
系统架构设计师(软考高级) - 工业和信息化部
2023年11月
证明大型系统架构设计与技术方案能力。
阿里云云计算工程师认证(ACP) - 阿里云
2022年6月
证明云上计算、存储与容器服务能力。
荣誉奖项
北京市科学技术进步奖三等奖
校级优秀毕业生
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